Озеро Нижнее Пигмозеро расположено в северо-западной части Заонежского полуострова. Площадь водной поверхности озера - 13,96 кв. км. Наибольшая длина - 8 км, наибольшая ширина - 2,7 км. Средняя глубина 4,9 м, наибольшая 13 м. Зона с глубинами от 0 до 4 м занимает 74% площади озера, от 4 до 10 м - 20,9% и свыше 10 м - 5,1%. Имеются луды и ямы. На озере расположено 2 острова общей площадью 0,44 кв. км.
Нижнее Пигмозеро имеет неправильную форму. Центральная часть его наиболее широкая, южный конец образует 2 залива. Берега низкие, большей частью песчаные. Окрестности покрыты хвойным лесом.
В северный конец озера впадает р.Пигмозерка, вытекающая из о.Верхнее Пигмозеро. Стоком является р.Нижняя Пигмозерка - приток Уницкой губы Онежского озера.
В Нижнем Пигмозере водятся щука, плотва; налим, окунь и ерш.
